Biosynthesis and accumulation of terpenoids in plants : production of energy-rich triterpenoids in Euphorbia lathyris, a potential crop for third generation biofuels
Ressource documentaire
Biosynthesis and accumulation of terpenoids in plants : production of energy-rich triterpenoids in Euphorbia lathyris, a potential crop for third generation biofuels
L’objectif de ce projet de thèse était de caractériser le métabolisme de terpénoïdes (ou isoprénoïdes) chez les plantes supérieures. L’essentiel du travail a consisté à caractériser des triterpènes synthases (TTPS) d’Arabidopsis thaliana, un modèle végétal, ainsi que celles de l’épurge (Euphorbia lathyris), une euphorbe pour laquelle des applications agronomiques sont envisagées. Au cours de ma thèse, j’ai aussi contribué à l’étude du métabolisme et des fonctions des précurseurs de triterpènes et de stérols, ainsi qu’à leurs fonctions biologiques.Les triterpènes synthases, ou 2,3-oxydosqualène cyclases (OSCs), convertissent le substrat 2,3-oxydosqualene (SqO) en une multitude d'alcools triterpéniques, et ainsi amorcent la biosynthèse de dérivés triterpénoïdes (triterpènes oxydés, conjugués, etc ..). Arabidopsis thaliana contient 13 OSCs produisant divers squelettes triterpéniques, de type stéroïdien ou non-stéroïdien. Les produits de cyclisation du SqO ont été élucidés structuralement (GC-MS, RMN) après expression hétérologue des enzymes en levure erg7. Cette levure est déficiente en lanostérol synthase (ERG7), ce qui permet d'accumuler le SqO, substrat des cyclases. Lorsque le mutant est transformé avec un ADNc codant une triterpène synthase, il est capable de convertir le SqO en un ou plusieurs triterpènes. Cependant, la caractérisation des 13 OSCs d'Arabidopsis réalisée de façon hétérologue en levure n’a pas été établie inplanta. De façon surprenante, certains des composés produits dans les levures erg7 transformées n'ont jamais été détectés chez Arabidopsis. C'est pourquoi il a été nécessaire de reconsidérer les fonctions biochimiques exactes de ces enzymes dans un contexte végétal.. The subject of this PhD thesis is part of a research project entitled "Production of energy-rich triterpenoids in Euphorbia lathyris, a potential crop for third generation biofuels," whose acronym is EULAFUEL. This project is funded by a multipartner program ANR-KBBE and has been extended until December 2013. The aim of this PhD project is to get new insights into the aspects related with the biosynthesis and accumulation of latex triterpenoids. In addition, for comparison, a major objective of the thesis is to characterize functionally the enzymes involved in the synthesis of triterpenes in the model plant Arabidopsis thaliana. Triterpene synthases, also named oxidosqualene cyclases (OSCs), convert 2,3-oxidosqualene (OS) into a multitude of triterpene alcohols and there by initiate triterpene biosynthesis. Arabidopsis thaliana for instance has 13 OSCs producing diverse skeletons of steroidal or non-steroidal triterpenes. Cyclization products of a given enzyme have been characterized biochemically using a yeast heterologous expression system. However, for the majority of Arabidopsis triterpene synthases, inplanta studies are lacking. In fact, most of the compounds produced in yeast expressing such enzymes have never been detected in wild-type Arabidopsis. This is a reason why we should reconsider the exact biochemical function of triterpene synthases in the plant context. Then, in a comparative approach in E. lathyris, we project to study the specific triterpene accumulation in the laticifers, a specialized cell type where high amounts of lanosterol, an unusual OS cyclization product for plants, accumulate.
L’objectif de ce projet de thèse était de caractériser le métabolisme de terpénoïdes (ou isoprénoïdes) chez les plantes supérieures. L’essentiel du travail a consisté à caractériser des triterpènes synthases (TTPS) d’Arabidopsis thaliana, un modèle végétal, ainsi que celles de l’épurge (Euphorbia lathyris), une euphorbe pour laquelle des applications agronomiques sont envisagées. Au cours de ma thèse, j’ai aussi contribué à l’étude du métabolisme et des fonctions des précurseurs de triterpènes et de stérols, ainsi qu’à leurs fonctions biologiques.Les triterpènes synthases, ou 2,3-oxydosqualène cyclases (OSCs), convertissent le substrat 2,3-oxydosqualene (SqO) en une multitude d'alcools triterpéniques, et ainsi amorcent la biosynthèse de dérivés triterpénoïdes (triterpènes oxydés, conjugués, etc ..). Arabidopsis thaliana contient 13 OSCs produisant divers squelettes triterpéniques, de type stéroïdien ou non-stéroïdien. Les produits de cyclisation du SqO ont été élucidés structuralement (GC-MS, RMN) après expression hétérologue des enzymes en levure erg7. Cette levure est déficiente en lanostérol synthase (ERG7), ce qui permet d'accumuler le SqO, substrat des cyclases. Lorsque le mutant est transformé avec un ADNc codant une triterpène synthase, il est capable de convertir le SqO en un ou plusieurs triterpènes. Cependant, la caractérisation des 13 OSCs d'Arabidopsis réalisée de façon hétérologue en levure n’a pas été établie inplanta. De façon surprenante, certains des composés produits dans les levures erg7 transformées n'ont jamais été détectés chez Arabidopsis. C'est pourquoi il a été nécessaire de reconsidérer les fonctions biochimiques exactes de ces enzymes dans un contexte végétal.. The subject of this PhD thesis is part of a research project entitled "Production of energy-rich triterpenoids in Euphorbia lathyris, a potential crop for third generation biofuels," whose acronym is EULAFUEL. This project is funded by a multipartner program ANR-KBBE and has been extended until December 2013. The aim of this PhD project is to get new insights into the aspects related with the biosynthesis and accumulation of latex triterpenoids. In addition, for comparison, a major objective of the thesis is to characterize functionally the enzymes involved in the synthesis of triterpenes in the model plant Arabidopsis thaliana. Triterpene synthases, also named oxidosqualene cyclases (OSCs), convert 2,3-oxidosqualene (OS) into a multitude of triterpene alcohols and there by initiate triterpene biosynthesis. Arabidopsis thaliana for instance has 13 OSCs producing diverse skeletons of steroidal or non-steroidal triterpenes. Cyclization products of a given enzyme have been characterized biochemically using a yeast heterologous expression system. However, for the majority of Arabidopsis triterpene synthases, inplanta studies are lacking. In fact, most of the compounds produced in yeast expressing such enzymes have never been detected in wild-type Arabidopsis. This is a reason why we should reconsider the exact biochemical function of triterpene synthases in the plant context. Then, in a comparative approach in E. lathyris, we project to study the specific triterpene accumulation in the laticifers, a specialized cell type where high amounts of lanosterol, an unusual OS cyclization product for plants, accumulate.